以下就是针对MySQL作为专门的数据库服务器的优化建议：

MySQL服务器的规划

为了以后维护，升级备份的方便和数据的安全性，最好将MySQL程序文件和数据分别安装在“不同的硬件”上。


         /   /         |    /usr                     <== 操作系统                 |    /home/mysql              <== mysql主目录，为了方便升级，这只硬盘1==>|                                 是一个最新版本目录的链接         |    /home/mysql-3.23.54/     <== 最新版本的mysql /home/mysql链接到这里         \   /home/mysql-old/         <== 以前运行的旧版本的mysql         /   /data/app_1/             <== 应用数据和启动脚本等硬盘2==>|    /data/app_2/         \   /data/app_3/


MySQL服务的安装和服务的启动

MySQL一般使用当前STABLE的版本：

尽量不使用--with-charset=选项，我感觉with-charset只在按字母排序的时候才有用，这些选项会对数据的迁移带来很多麻烦。

尽量不使用innodb，innodb主要用于需要外键，事务等企业级支持，代价是速度比MYISAM有数量级的下降。

./configure --prefix=/home/mysql --without-innodb
make
make install

服务的启动和停止

1 复制缺省的mysql/var/mysql到 /data/app_1/目录下。

2 MySQLD的启动脚本：start_mysql.sh

#!/bin/sh
rundir=`dirname "$0"`
echo "$rundir"
/home/mysql/bin/safe_mysqld --user=mysql --pid-file=
"$rundir"/mysql.pid --datadir="$rundir"/var "$@"\-O
max_connections=500 -O wait_timeout=600 -O key_buffer=
32M --port=3402 --socket="$rundir"/mysql.sock &



注释：

--pid-file="$rundir"/mysql.pid --socket="$rundir"/mysql.sock --datadir="$rundir"/var

目的都是将相应数据和应用临时文件放在一起；
-O 后面一般是服务器启动全局变量优化参数，有时候需要根据具体应用调整；
--port: 不同的应用使用PORT参数分布到不同的服务上去，一个服务可以提供的连接数一般是MySQL服务的主要瓶颈；

修改不同的服务到不同的端口后，在rc.local文件中加入：

/data/app_1/start_mysql.sh
/data/app_2/start_mysql.sh
/data/app_3/start_mysql.sh

注意：必须写全路径

3 MySQLD的停止脚本：stop_mysql.sh

#!/bin/sh
rundir=`dirname "$0"`
echo "$rundir"
/home/mysql/bin/mysqladmin -u mysql -S"$rundir"/mysql.sock shutdown



使用这个脚本的好处在于：

1 多个服务启动：对于不同服务只需要修改脚本中的--port[=端口号]参数。单个目录下的数据和服务脚本都是可以独立打包的。
2 所有服务相应文件都位于/data/app_1/目录下：比如：mysql.pid mysql.sock，当一台服务器上启动多个服务时，多个服务不会互相影响。但都放到缺省的/tmp/下则有可能被其他应用误删。
3 当硬盘1出问题以后，直接将硬盘2放到一台装好MySQL的服务器上就可以立刻恢复服务（如果放到my.cnf里则还需要备份相应的配置文件）。

服务启动后/data/app_1/下相应的文件和目录分布如下：

/data/app_1/
    start_mysql.sh 服务启动脚本
    stop_mysql.sh 服务停止脚本
    mysql.pid 服务的进程ID
    mysql.sock 服务的SOCK
    var/ 数据区
       mysql/ 用户库
       app_1_db_1/ 应用库
       app_1_db_2/
...
/data/app_2/
...




查看所有的应用进程ID：
cat /data/*/mysql.pid

查看所有数据库的错误日志：
cat /data/*/var/*.err

个人建议：MySQL的主要瓶颈在PORT的连接数上，因此，将表结构优化好以后，相应单个MySQL服务的CPU占用仍然在10％以上，就要考虑将服务拆分到多个PORT上运行了。