新疆生产建设兵团的人员大都是从中国人民解放军第一野战军的第一兵团和第二十二兵团转业而来的。目前兵团下设14个师（其中包含1个建筑工程师）和185个农牧团场（其中包含11个建筑工程团）及9个半军工企业，插花地分布于自治区全境，位于1950年以前的荒地。2003年兵团总人口大约为248万人，其中汉族人口约218万。

农一师：1953年成立，分布在阿克苏地区，师部驻阿克苏市。前身是第一兵团第二军步兵第五师，最早是中国工农红军第二方面军第六军团和国民革命军第十八集团军一二零师三五九旅，以“生在井冈山，长在南泥湾，转战数万里，屯垦在天山”闻名。第2军第5师第14团改编为新疆军区农业建设第1师第1团。第15团改编为新疆军区农业建设第1师第1团。。
农二师：1953年成立，前身是第一兵团步兵第六师，主要分布在巴音郭楞蒙古自治州境内，师部驻库尔勒市，前身是第一兵团第二军步兵第六师。 第２军第6师第16、17、18团依次改编为新疆军区农业建设第2师第5、6、7团。
农三师：1966年成立，主要分布在喀什地区境内，师部与图木舒克市师市合一，前身是第一兵团第五军步兵第十四师。
农四师：1953年成立，主要分布在伊犁哈萨克自治州直属伊犁地区境内，师部驻伊宁市，前身是第一兵团第五军步兵第十五师。
农五师：1953年成立，主要分布在博尔塔拉蒙古自治州境内，师部驻博乐市，前身是第一兵团第六军步兵第十六师。
农六师：1953年成立，主要分布在昌吉回族自治州境内，师部与五家渠市师市合一。前身是第一兵团第六军步兵第十七师，即西北野战军新四旅。
农七师：1953年成立，主要分布在奎屯附近，师部驻奎屯市，前身是第二十二兵团第九军步兵第二十五师。
农八师：1953年成立，主要分布在石河子附近，师部驻石河子市，师部与石河子市师市合一，前身是第二十二兵团第九军步兵第二十六师。
农九师：1962年成立，主要分布在伊犁哈萨克自治州塔城地区北部边境地区，师部驻额敏县，前身是第二十二兵团第九军步兵第二十七师。
农十师：1959年成立，主要分布在伊犁哈萨克自治州阿勒泰地区境内，师部驻北屯镇，前身是第二十二兵团骑兵第七
师。
建筑工程师：1953年成立，以工业、工程施工为主，师部驻乌鲁木齐市，前身是第二十二兵团骑兵第八师。
农十二师：即原乌鲁木齐农场管理局，1982年成立，2001年改为现名，主要分布在乌鲁木齐市境内，师部驻乌鲁木齐市。
农十三师：即原哈密农场管理局，1982年成立，2001年改为现名，主要分布在哈密地区境内，师部驻哈密市。
农十四师：即原和田农场管理局，1982年成立，2001年改为现名，主要分布在和田地区境内，师部驻和田市。

兵团的师大都与自治区的地区分别对应，由相应的地委书记兼任师第一政委。师另设专职的政治委员和师长，行政级别为地厅级。
兵团的团级单位除了团场外，还有农场、牧场等，一般统称为“农牧团场”。团场编以数字番号。有些师实行师市合一体制。
在兵团总部、各师师部和团场密集的垦区，设有三级公安局、检察院、法院机构。
80年代以来，军团的武装连队改编为武警，整编为新疆生产建设兵团武警指挥部及其隶属的各支队、大队、中队。副军级建制的兵团军事部执行省军区的职责权限，即兵役动员、预备役编组、民兵工作等。兵团的各支民兵应急反应分队是新疆维护稳定、处置突发事件的重要力量